MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT14

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017209	TCCT	2	8	2825	2832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017209	TTA	2	6	2849	2854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017209	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017209	CTT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017209	ATT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017209	TGA	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017209	TCC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017209	TAAT	2	8	3098	3105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017209	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017209	CAAA	2	8	3161	3168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017209	CAT	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017209	GGT	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017209	CAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017209	A	6	6	3504	3509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017209	CAT	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017209	TCAT	2	8	3538	3545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017209	TAA	2	6	3623	3628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017209	ATC	2	6	3648	3653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017209	CAA	2	6	3688	3693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017209	TAGCAA	2	12	3697	3708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017209	TATC	2	8	3834	3841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017209	CATT	3	12	3874	3885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017209	CATT	2	8	3888	3895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017209	T	7	7	3894	3900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017209	A	8	8	4271	4278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017209	A	8	8	4302	4309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017209	ACTA	2	8	4530	4537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017209	TAAA	2	8	4538	4545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017209	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017209	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017209	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017209	TATTT	2	10	4603	4612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017209	T	6	6	4610	4615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017209	AT	3	6	5664	5669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017209	A	6	6	5690	5695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017209	T	9	9	5798	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017209	CATA	2	8	5836	5843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017209	AAAG	2	8	5882	5889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017209	A	9	9	5923	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017209	AAAT	2	8	5966	5973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017209	TCT	2	6	6020	6025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017209	T	6	6	6041	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017209	CCA	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017209	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017209	T	7	7	6106	6112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017209	A	7	7	6125	6131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017209	TAA	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017209	T	7	7	6291	6297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017209	TCT	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017209	ACA	2	6	7297	7302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017209	T	6	6	7337	7342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017209	TCA	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017209	A	7	7	7394	7400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017209	T	7	7	7431	7437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017209	AGGGA	2	10	7479	7488	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017209	ACAA	2	8	7576	7583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017209	A	6	6	8153	8158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017209	TATTAA	2	12	8175	8186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017209	AATAA	2	10	8204	8213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017209	TTA	2	6	8219	8224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017209	TA	3	6	8233	8238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017209	A	6	6	8247	8252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017209	CAAAC	2	10	8294	8303	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017209	CCT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017209	TAAA	2	8	8598	8605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017209	A	7	7	8624	8630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017209	ATT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017209	T	7	7	8655	8661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017209	TA	4	8	8744	8751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017209	ATAC	2	8	8756	8763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017209	TGT	2	6	8766	8771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017209	AAC	2	6	8772	8777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017209	CATA	2	8	8793	8800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017209	CTT	2	6	9835	9840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017209	AAC	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017209	AAC	2	6	9920	9925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017209	CTAT	2	8	9929	9936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017209	GTA	2	6	9965	9970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017209	T	6	6	10033	10038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017209	AT	3	6	10083	10088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017209	TAC	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017209	TTTC	2	8	10151	10158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017209	GAAG	2	8	10226	10233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017209	AATG	2	8	10284	10291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017209	TC	3	6	10309	10314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017209	TC	3	6	10355	10360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017209	TCA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017209	CCA	2	6	10395	10400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017209	A	6	6	10415	10420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017209	TCA	2	6	10443	10448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017209	CCTT	2	8	10652	10659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017209	ATTTA	2	10	10660	10669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017209	TA	3	6	10668	10673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017209	TCC	2	6	10685	10690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017209	CGTT	2	8	12068	12075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017209	T	6	6	12074	12079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017209	TA	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017209	TAAT	2	8	12150	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017209	ATTTT	2	10	12186	12195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017209	AT	3	6	12204	12209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017209	AAAC	2	8	12237	12244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017209	ATT	2	6	12282	12287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017209	AAATCA	2	12	12318	12329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017209	AAT	2	6	12337	12342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017209	CCA	2	6	13169	13174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017209	ATA	2	6	13232	13237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017209	CCT	2	6	14597	14602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017209	TGA	2	6	14672	14677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017209	ACAA	2	8	14744	14751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017209	ATT	2	6	14793	14798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017209	CTA	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017209	TAG	2	6	14848	14853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.